Z Prahy do Třeboně vede cesta po brněnské dálnici, v Mirošovicích je třeba odbočit na Tábor a odtud pokračovat ve směru na České Budějovice. Za Veselím nad Lužnicí odbočíte už přímo na Třeboň. Tato cesta je dlouhá necelých 150 kilometrů. Možné je jet i směrem na Strakonice a přes Písek do Českých Budějovic. Odtud je Třeboň vzdálená 25 kilometrů. Celkem ujedete zhruba 170 kilometrů. Z východní části země je ideální jet po brněnské dálnici směrem na Prahu a v Humpolci odbočit na Pelhřimov, Jindřichův Hradec a Třeboň.

Pravidelně jezdí do Třeboně vlaky a autobusy. Více informací na www.jizdnirady.cz.